Der Suhrer See zeigt eine stabile Sauerstoff- und Temperaturschichtung mit niedrigen Tiefenwassertemperaturen. Das Einzugsgebiet ist relativ klein und weist keine nennenswerten oberflächlichen Zuflüsse auf. Es ist durch Siedlungs- und Verkehrsflächen sowie durch Wald, Acker- und Grünland geprägt. Dieses Gewässer ist im Unterschied zu den meisten beobachteten Seen dieser Region durch einen relativ geringen Nährstoffgehalt und Eutrophierungsgrad gekennzeichnet, der eine spezielle Unterwasserflora und -fauna von bundesweiter Bedeutung begünstigt. Zudem stellt es ein bedeutendes Mauser, Rast- und Winterquartier verschiedener Wasservogelarten dar. Der Suhrer See ist mit dem überwiegenden Teil seines Uferbereichs sowie den angrenzenden Wäldern als Naturschutzgebiet ausgewiesen worden. Der Wasserstand des Suhrersees wurde 1922 an der Ölmühle um 30 cm abgesenkt.